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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

华罗庚的最后一天******

　　中新社北京1985年6月15日电(记者/戴亚平)中国著名数学家华罗庚在东京逝世的噩耗传来后，本社记者向有关方面了解了这位教授在世的最后一天的情况。

　　6月12日，是华罗庚教授访问日本的第10天。为准备到东京大学向日本数学界同仁作学术报告，11日晚上没有休息好，深夜服下安眠药后才入睡。12日下午两时，华罗庚教授与日本知名数学家会晤，近三点钟回到旅馆，稍事休息后到东京大学作学术报告。

　　6月12日下午四时整，学术报告会开始举行。华罗庚教授走上讲台作报告。

　　华罗庚教授已是74岁高龄，在国内曾遇过两次心肌梗塞的危险。近几年，由于他腿疾日益严重，活动不便，只好坐轮椅。6月12日在东京大学作学术报告时，他离开轮椅，自始至终站在讲台上讲演。

　　华罗庚教授先用国语演讲，由译员译成日语。他感到经过翻译很费时，征得主人同意后，改用英语演讲。华罗庚教授脱下西装上衣，接着又解下领带，兴致勃勃地讲演。

　　演讲规定时间已超过，华罗庚问会议主席：“我可以延长几分钟吗？”主席点头同意。他圆满地结束了整个学术报告，历时65分钟。这时是东京时间17时16分。

　　华罗庚教授迎着热烈的掌声走下讲台，迈向轮椅。突然，他从轮椅上滑下来，身边的人没有扶住。华罗庚教授倒在地上。在场的医生立即抢救，替华罗庚做人工呼吸和心脏按摩。东京急救站医生携带心脏起搏器和心脏监测仪迅速赶到东京大学。东京大学著名心脏病专家杉木教授也闻讯赶来指挥抢救工作。

　　18时15分，华罗庚教授被送进东京大学医院部急诊室。经过日本医生全力抢救无效，华罗庚教授的心脏停止跳动。

　　不久前，华罗庚教授曾说过：他剩下的时间最多只有五年，他要用所有的时间工作。华罗庚教授毕生驰骋在“数学王国”里，他最后在数学讲坛上走完生命之路。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）